Kejadian bermula pada Kamis, 16 April 2026 sekitar pukul 14.00 WIB, saat saksi atas nama Wagiso (46 tahun), seorang pencari kayu, berada di sekitar aliran Sungai Wawar wilayah Wiromartan, Kecamatan Mirit, Kabupaten Kebumen. Saksi menerima informasi dari warga mengenai adanya anak yang diduga tenggelam di sungai. Saksi kemudian segera menuju lokasi dan melihat seorang anak dalam kondisi hampir tenggelam. Upaya penyelamatan langsung dilakukan dan satu korban berhasil dievakuasi ke tepi sungai dalam keadaan selamat. Dari keterangan korban selamat, diketahui masih terdapat dua anak lain yang ikut terseret arus.
Peristiwa tersebut kemudian dilaporkan kepada pemerintah desa dan diteruskan kepada unsur terkait. Tim gabungan yang terdiri dari BPBD, Basarnas, TNI, Polri, PMI, relawan, dan warga segera melakukan asesmen serta operasi pencarian. Pada hari yang sama, salah satu korban atas nama Alfin (12 tahun) berhasil ditemukan dalam kondisi meninggal dunia sejauh kurang lebih 4 kilometer dari lokasi kejadian dan selanjutnya dibawa ke fasilitas kesehatan sebelum diserahkan ke pihak keluarga. Sementara itu, pencarian terhadap satu korban lainnya atas nama Zaki (12 tahun) terus dilakukan dengan metode penyisiran di sepanjang aliran sungai hingga area pesisir. Operasi pencarian hari pertama dihentikan sementara pada pukul 18.00 WIB dan dilanjutkan keesokan harinya dengan memperluas area pencarian ke arah timur dan barat dari titik muara.
Pada perkembangan selanjutnya, Tim SAR Gabungan menerima informasi dari seorang pemancing terkait penemuan jenazah di kawasan Pantai Laguna Lembahpurwo pada tanggal 16 April 2026 pukul 22.25 WIB. Selang dua menit kemudian, pada pukul 22.27 WIB, tim bergerak menuju lokasi untuk melakukan asesmen dan memastikan identitas korban. Setelah dipastikan, pada tanggal 17 April 2026 pukul 00.30 WIB, tim berhasil mengevakuasi korban atas nama Zaki (12 tahun) dalam kondisi meninggal dunia pada koordinat 7°49'21.9"S 109°47'28.7"E atau sekitar 3,5 kilometer ke arah barat dari lokasi kejadian awal. Jenazah kemudian dibawa ke rumah duka untuk penanganan lebih lanjut.
Dengan ditemukannya seluruh korban, pada pukul 01.30 WIB dilakukan debriefing oleh Tim SAR Gabungan dan operasi pencarian serta pertolongan (Ops SAR) diusulkan untuk ditutup. Seluruh unsur yang terlibat kemudian dikembalikan ke satuan masing-masing disertai ucapan terima kasih atas pelaksanaan tugas dan kerja sama selama operasi berlangsung.